A.I.C.O.: Инкарнация

События разворачиваются в Японии 2035 года. Крупный инцидент, известный как Взрыв, произошел в результате исследований искусственных организмов. Один из них, названный впоследствии Материей, выбрался из исследовательского центра и распространился по ущелью Куробэ. Правительство закрыло доступ в исследовательский город, который ранее считался перспективным проектом для человечества.

Пятнадцатилетняя Айко Татибана потеряла семью во время Взрыва. Через два года переведенный ученик Юи Кандзаки сообщает ей информацию об инциденте и секрете, связанном с ее телом. Недостающие сведения находятся в Первичной Точке - эпицентре Взрыва. Айко в сопровождении Юи и команды дайверов, использующих органические костюмы для работы на территории, поглощенной Материей, отправляется в запретную зону для выяснения обстоятельств произошедшего.