Киборг 009 и войны монстров

После побега от организации "Черный призрак" киборги, ранее восставшие против этой группировки, расселились по разным странам и ведут мирную жизнь. Ситуация меняется, когда неизвестное существо, напоминающее динозавра, начинает атаковать города и людей с помощью звуковых волн. Доктор Айзек Гилмор приходит к выводу, что за этими нападениями стоит "Черный призрак", и предпринимает попытку вновь собрать киборгов вместе.

Лидером группы становится Джо Симамура, известный как Киборг 009. К сопротивлению присоединяется загадочная Елена, утверждающая, что осталась сиротой в результате атак монстра. Киборги используют подводный летательный аппарат "Дельфин", оснащенный средствами противодействия ультразвуку, чтобы отправиться на поиски монстра и нового убежища "Черного призрака".