Исчезновение Юки Нагато

Главный герой - Юки Нагато, застенчивая любительница чтения и видеоигр. Она занимает пост президента литературного клуба старшей школы Кита. В клубе также состоят её друзья - осторожная Рёко Асакура и обычный ученик Кён. Юки ценит спокойное времяпрепровождение в их компании, особенно в присутствии Кёна, к которому она испытывает симпатию. К ним часто присоединяются Цуруя и Микуру Асахина - две подруги с противоположными характерами.

В декабрьский день по пути домой Юки встречает девочку, которая пытается поймать Санта-Клауса и заставляет её рисовать странные символы на земле. Девочка представляется Харухи Судзумией - эксцентричной ученицей престижной академии Коёэн, которая ищет инопланетян, путешественников во времени и экстрасенсов. Харухи вместе с другом Ицуки Коидзуми внезапно появляется в клубе и объявляет себя его новым исполнительным президентом. Спокойные дни литературного клуба заканчиваются - Юки и её друзья втягиваются в череду приключений под руководством Харухи. Каждое происшествие сближает Юки и Кёна.