Воины-марионетки от Джей до Икс

События разворачиваются через несколько месяцев после окончания OVA-сериала Saber Marionette J. Главный герой Отару и его марионетки Лайм, Черри и Бладберри продолжают свою обычную жизнь. Злодей Фауст возвращается и вновь начинает эксперименты с технологией марионеток, которая не предназначена для использования. Сабер Доллы, ранее противостоявшие Отару, оказываются перед выбором между преданностью Фаусту и возникшими чувствами к главному герою.

Отару и его марионеткам предстоит снова остановить Фауста, который угрожает их миру. Исход противостояния зависит от того, на чью сторону встанут Сабер Доллы. Если они сохранят верность Фаусту, это может привести к уничтожению Отару и его команды. Если же их привязанность к Отару окажется сильнее, баланс сил изменится.