Космический линкор Ямато

В 2199 году Земля подвергается атаке инопланетной расы из Империи Гамилус под руководством Лорда Деслера. Противник использует радиоактивные астероиды для обстрела поверхности планеты, делая её непригодной для жизни. Человечество вынуждено переселиться в подземные города, но радиация постепенно проникает и туда.

На Марсе терпит крушение инопланетный корабль. Члены экипажа Сусуму Кодай и Дайсукэ Сима обнаруживают на борту тело девушки с посланием от правительницы планеты Искандер. В сообщении Старся Искандар предлагает землянам помощь в борьбе с угрозой и упоминает устройство, способное очистить поверхность Земли от радиации. К посланию прилагается инструкция для создания мощного космического двигателя. Используя затонувший во время Второй Мировой войны корабль "Ямато", герои модифицируют его и отправляются к Искандеру под командованием капитана Дзюдзо Окиты. На путешествие отводится ровно год, иначе человечество погибнет.