События аниме происходят в 2071 году, за несколько дней до Хэллоуина. В столице Марса распространяется смертельный вирус. Правительство объявляет награду в триста миллионов вулонгов за поимку причастных к этому инциденту. Экипаж космического корабля Бибоп включает Спайка Шпигеля, Фэй Валентайн, Джета Блэка, Эдварда Вонг Хау Пепелу Тивруски IV и собаку Эйна. Они намерены найти виновных и получить вознаграждение. Однако на ту же награду претендуют другие охотники. Винсент Воладзю, ответственный

События разворачиваются через два года после истории, описанной в игре Final Fantasy VII. Мир постепенно восстанавливается после произошедших катаклизмов. В это время появляются две новые угрозы - болезнь Геостигма и три загадочных человека, которые разыскивают Дженову. Эти персонажи представляют потенциальную опасность для восстановленного порядка. Клауд и его союзники из оригинальной игры вынуждены снова объединиться. Их цель - противостоять возникшим угрозам и защитить мир от новой