Действие разворачивается в токийском районе Икэбукуро. В этом районе происходят различные события: фармацевтические компании занимаются незаконной деятельностью, люди исчезают, уличные банды ведут между собой конфликты. Среди местных жителей распространена легенда о безголовом мотоциклисте, который передвигается по ночам на чёрном байке. Главный герой Микадо Рюгаминэ переезжает в Икэбукуро по приглашению друга детства Масаоми Киды. В новом районе Микадо сталкивается с различными аспектами

В Токио 2039 года, через десятилетие после охватившего страну вируса, прозванного позже «Апокалипсис», всё находится под контролем мультинациональной организации GHQ, проводящей опыты в области генной инженерии. Сю Ома [桜満集] — обычный школьник в переходном возрасте, с людьми не особо ладит, хотя мечтает завести друзей и перестать быть таким неудачником. Однажды он встречает Инори [楪いのり], участвующую в группе сопротивления «Гробовщики», члены которой пилотируют меха-оружие для борьбы с