Руководитель проекта по восстановлению генома человека сталкивается с последствиями экологической катастрофы. Промышленные выбросы, радиоактивное заражение и разрушение озонового слоя привели к необратимым изменениям в ДНК большинства людей. Общество потребления, игнорировавшее предупреждения учёных, оказалось на грани вымирания. Главный герой возглавляет группу специалистов, пытающихся найти способ обратить процесс генетической деградации. В ходе исследований команда обнаруживает, что

Старшеклассница Нагиса Юкиай проживает в приморском городке. От своей бабушки она узнаёт о существовании «духов слов» (котодама) и приходит к убеждению, что эти сущности реальны. Возвращаясь из школы, Нагиса находит заброшенную радиостанцию. Она решает использовать оборудование и начать импровизированную радиопередачу. Голос девушки, переданный в эфир, привлекает внимание необычного слушателя, личность которого не соответствует её ожиданиям.

На планете Элтория, переживающей упадок, остались исследователи Флориан с дочерьми Амитией и Кирие. Их цель — найти способ восстановить жизнеспособность планеты. Реализации этого плана помешала болезнь отца семейства, Гранца Флориана. Вопреки возражениям старшей сестры, Кирие вместе с подругой детства Ирис отправляется в альтернативный мир. Они прибывают на Землю, в Японию, чтобы отыскать средство, способное возродить их родную планету. На Земле Кирие и Ирис встречают Наноху, Фейт и Хаятэ.

Группа старшеклассников готовится к выпускному и делится воспоминаниями о совместно проведённом времени. На следующий день персонажи участвуют в защите церемонии вручения дипломов от Зундара и монстра Второй Пуговицы, созданного Дадачей. В ходе столкновения Юмото испытывает трудности с применением своей силы, основанной на любви. Основное действие разворачивается вокруг выпускного мероприятия, которое оказывается под угрозой из-за вмешательства антагонистов. Персонажи вынуждены объединиться для